Садржај
Геномицс је грана генетике која проучава велике промене генома организама. Геномика и њено потпоље транскриптомике, која проучава промене у генима која се преносе из ДНК у целим генима, проучава много гена. Геномика такође може укључивати читање и прилагођавање веома дугих низова ДНК или РНК. За анализу и тумачење тако великих, сложених података потребна је помоћ рачунара. Људски ум, какав је врхунски, неспособан је да поднесе толико информација. Биоинформатика је хибридно поље које обједињује знања о биологији и сазнања из информационих наука, које су поткатегорија рачунарске науке.
Геноми садрже много информација
Геноми организама су веома велики. Процењује се да људски геном има три милијарде парова који садрже око 25.000 гена. За поређење, процењује се да воћна муха има 165 милијарди базних парова који садрже 13.000 гена. Поред тога, подпоље геномике названо транскриптомијским истраживањима у којем се гени, међу десетинама хиљада у организму, укључују или искључују у одређено време, кроз више временских тачака и више експерименталних услова у свакој временској тачки. Другим речима, подаци о „омици“ садрже огромне количине информација које људски ум не може да схвати без помоћи рачунских метода у биоинформатици.
Биолошки подаци
Биоинформатика је важна за генетичка истраживања јер генетски подаци имају кон. Цон је биологија. Животни облици имају одређена правила понашања. Исто се односи на ткива и ћелије, гене и протеине. Међусобно делују на одређене начине и на одређени начин се регулишу. Обимни, сложени подаци који се генеришу у геномици не би имали смисла без усвојеног сазнања о начину на који функционишу животни облици. Подаци добијени геномиком могу се анализирати истим методама које користе инжињери и физичари који проучавају тржишта финансија и оптику влакана, али за анализу података на начин који има смисла захтева знање из биологије. Тако је биоинформатика постала непроцењиво хибридно поље знања.
Црунцхинг Хиљаде бројева
Смањивање броја је начин да се каже да неко ради прорачуне. Биоинформатика је у стању да дроби десетине хиљада бројева у неколико минута, зависно од тога колико брзо рачунар може да обради информације. Омицс истраживање користи рачунаре за покретање алгоритама - математичких израчунавања - у великој мери како би се пронашли обрасци у великим скупима података. Уобичајени алгоритми укључују функције попут хијерархијског кластерирања (види референцу 3) и анализу главних компоненти. Обе су технике проналажења односа између узорака који у себи имају много фактора. То је слично утврђивању да ли су одређене етничке групе чешће између два одељка у телефонском именику: презимена која почињу са А у односу на презимена која почињу са словом Б.
Систем Биологи
Биоинформатика је омогућила проучавање понашања система који има хиљаде делова који се крећу на нивоу свих делова који се крећу одједном. То је као гледати јато птица које заједно лете или школа риба једновремено плива. Раније су генетичари проучавали само један ген одједном. Иако тај приступ и даље има невјеројатно пуно заслуга и наставит ће то и даље, биоинформатика је омогућила нова открића. Системска биологија представља приступ проучавању биолошког система квантификовањем више покретних делова, попут проучавања колективне брзине различитих џепова птица који лете као једно велико стадо, које се помера.