Садржај
У 19. веку таксономија - класификација живих организама - била је сав бијес у биологији. И аматери и професионални природњаци били су толико заокупљени злогом прикупљања и идентификовања бића, да су ретки букови били добра роба. У то време се мало знало о микроорганизмима и њиховом месту у свету живих бића, а класификација микробиологије није полагала толико пажње. У деценијама које су уследиле дошло је до драматичног пораста знања о микробима и у методама идентификације микроорганизама, а део тог пораста показао се ефикасном класификацијом микроорганизама.
Компоненте таксономије
Таксономија има три компоненте: номенклатуру, класификацију и идентификацију. Номенклатура је једноставно додељивање имена некој врсти. Класификација је групирање врста заједно према заједничким карактеристикама - од којих су неке физичке, а неке биохемијске. За идентификацију се користе особине организма да би се утврдило где му припада у класификационој шеми. Савремена таксономска шема има највећу, инклузивнију групу, домене. Најмања група су врсте. Од најинклузивнијег до најконкретнијег нивоа, тече тако: домен, краљевство, типичност, класа, ред, породица, род и врсте. Ви сте, на пример, Еукариа Анималиа Цхордата Маммалиа Примате Хоминидае Хомо сапиенс.
Микроорганизми и домени
Микроорганизми су изузетно разнолики. Они нису дефинисани неком посебном врстом структуре или функције, већ једноставно њиховом величином. Микроорганизми су толико различити да спадају у све три различите класификације највишег нивоа - сва три домена. Један домен је бактерија, други је археја, а крајњи је еукарија. Сви чланови домена бактерија и археја су једноцелични микроорганизми. Обе ћелије немају мембране које раздвајају њихов генетски материјал од остатка ћелије - мембране које дефинишу језгро. Дакле, сва краљевства, пхила, класе, редови, породице, родови и врсте унутар домена бактерија и архаеа су микроорганизми.
Једноћелијски протисти
Еукарија су организми чије ћелије садрже језгро. Многи еукариотски организми су једноцелични микроорганизми, али многи други - попут стабала црвеног дрвета или ви - нисте. Стога су потребне додатне класификације. Краљевство Протиста у домену Еукариа састоји се од само једноћелијских микроорганизама. Протисти су раздвојени у три различите групе пхила: четири различите пхила алге, четири различите протозое пхила и две различите пхила. Али сви организми унутар ове филе - сви у краљевству Протиста - су микроорганизми.
Микроскопске гљивице
Краљевство Фунги је садржано у домену Еукариа. Неке од пхила унутар гљивица садрже микроорганизме. На пример, фијум Зигомицота садржи микроскопске калупе за хлеб, а пх Асумицота садржи квасце и микробне штеточине и паразите. Лишајеви су симбиотски скуп гљива и фотосинтетски организам - који се делимично налазе у краљевству Фунги, а делом у другим краљевствима, или чак другим доменима.