Садржај
- ТЛ; ДР (Предуго; нисам прочитао)
- Опис Рибосома
- Преваленција Рибосома
- Рибосоми су фабрика протеина
- Ко је открио рибосоме?
- Откриће структуре рибосома
- Шта је рибозим?
- Категоризација Рибосома према Сведберговим вредностима
- Значај структуре Рибосома
Рибосоми су познати као произвођачи протеина свих ћелија. Протеини контролирају и граде живот.
Стога су рибосоми неопходни за живот. Упркос њиховом открићу 50-их година прошлог века, требало је неколико деценија да су научници заиста расветлили структуру рибосома.
ТЛ; ДР (Предуго; нисам прочитао)
Рибосоме, познате као фабрике протеина свих ћелија, први је открио Георге Е. Паладе. Међутим, структуру рибосома деценијама касније утврдили су Ада Е. Ионатх, Тхомас А. Стеитз и Венкатраман Рамакрисхнан.
Опис Рибосома
Рибосоми су добили своје име по „рибо“ рибонуклеинске киселине (РНА) и „сома“, што на латинском значи „тело“.
Научници дефинишу рибосоме као структуру која се налази у ћелијама, као једна од неколико мањих ћелијских подскупова органеле. Рибосоми имају две подјединице, једну велику и једну малу. Нуклеолус чини ове подјединице, које се међусобно закључавају. Рибосомална РНА и протеини (рибопротеини) чине рибосом.
Неки рибосоми лебде међу цитоплазмом ћелије, док се други причвршћују на ендоплазматски ретикулум (ЕР). Назива се ендоплазматски ретикулум испуњен рибосомима груби ендоплазматски ретикулум (РЕР); тхе тхе глатки ендоплазматски ретикулум (СЕР) нема прикачених рибосома.
Преваленција Рибосома
У зависности од организма, ћелија може имати неколико хиљада или чак милион рибосома. Рибосоми постоје и у ћелијама прокариотских и еукариотских. Такође се могу наћи у бактеријама, митохондријама и хлоропластима. Рибосоми су распрострањенији у ћелијама којима је потребна стална синтеза протеина, попут ћелија мозга или панкреаса.
Неки рибосоми могу бити прилично масивни. У еукариотама могу имати 80 протеина и бити направљени од неколико милиона атома. Њихова РНА порција заузима више масе него део протеина.
Рибосоми су фабрика протеина
Рибосоми узимају кодони, који су серија од три нуклеотида, из мессенгер РНА (мРНА). Кодон служи као предложак из ДНК ћелије да би се направио одређени протеин. Рибосоми затим преводе кодоне и одговарају их аминокиселинама из пренос РНА (тРНА). То је познато као превод.
Рибосом има три места за везивање тРНА: ан аминоацил везивачко место (веб локација) за везивање аминокиселина, а пептидил сајт (П сајт) и ан излаз сајт (Е сајт).
Након овог процеса, преведена аминокиселина гради се на ланцу протеина који се зове а полипептид, све док рибосоми не доврше посао стварања протеина. Једном када се полипептид ослободи у цитоплазми, он постаје функционалан протеин. Због овог процеса рибосоми се често дефинишу као фабрике протеина. Три фазе производње протеина називају се иницијација, продужење и превод.
Ови машински рибосоми делују брзо, придружујући се 200 аминокиселина у минути у неким случајевима; прокариоти могу додати 20 аминокиселина у секунди. Сложени протеини се сакупљају неколико сати. Рибосоми чине већину од око 10 милијарди протеина у ћелијама сисара.
Завршени протеини могу заузврат да се подвргну даљим променама или савијању; ово се зове пост-транслациона модификација. Код еукариота Голџијев апарат комплетира протеин пре његовог ослобађања. Једном када рибосоми заврше са радом, њихове подјединице се или рециклирају или демонтирају.
Ко је открио рибосоме?
Георге Е. Паладе први је пут открио рибосоме 1955. године. Паладеов опис рибосома приказао их је као цитоплазматске честице које су повезане са мембраном ендоплазматског ретикулума. Паладе и други истраживачи открили су функцију рибосома, која је била синтеза протеина.
Францис Црицк би наставио да се формира централна догма биологије, који је сажео процес изградње живота као "ДНК чини РНА чини протеин."
Док је општи облик одређен електронским микроскопским сликама, требало би још неколико деценија да се утврди стварна структура рибосома. До овога је дошло у великој мери са релативно огромном величином рибосома, што је инхибирало анализу њихове структуре у кристалном облику.
Откриће структуре рибосома
Док је Паладе открио рибосом, други научници утврђивали су његову структуру. Три одвојена научника открила су структуру рибосома: Ада Е. Ионатх, Венкатраман Рамакрисхнан и Тхомас А. Стеитз. Ова три научника награђена су Нобеловом наградом за хемију 2009. године.
Откривање тродимензионалне структуре рибосома догодило се 2000. Године. Ионатх, рођен 1939. године, отворио је врата овом открићу. Њен почетни рад на овом пројекту почео је 1980-их. Користила је микробе из врелих извора како би изоловала своје рибосоме, због робусне природе у тешким условима. Могла је да кристализује рибосоме тако да се могу анализирати рендгенском кристалографијом.
Ово је генерисало шаре тачака на детектору тако да се могу препознати положаји рибосомалних атома. Ионатх је на крају произвео висококвалитетне кристале користећи крио-кристалографију, што значи да су рибосомални кристали били замрзнути како би се сачувало од распада.
Научници су тада покушали да разјасне „фазни угао“ за узорке тачака. Како се технологија побољшавала, усавршавање поступка довело је до детаља на нивоу једног атома. Стеитз, рођен 1940. године, успео је да открије који кораци реакције укључују који атоми, на везама аминокиселина. Открио је податке о фазама за већу јединицу рибосома 1998. године.
Рамакрисхан, рођен 1952, радио је за решавање фазе дифракције рендгенских зрака за добру молекуларну мапу. Открио је податке о фази за мању подјединицу рибосома.
Данас су даљи напредак у потпуној кристалографији рибосома довели до бољег разрешавања сложених структура рибосома. У 2010. години научници су успешно кристализовали еукариотске 80С рибосоме Саццхаромицес церевисиае и били су у могућности да мапирају његову структуру рендгенских зрака („80С“ је врста категоризације која се назива Сведбергова вредност; више о томе укратко). То је заузврат довело до више информација о синтези и регулацији протеина.
До сада се показало да су рибосоми мањих организама најлакши за утврђивање структуре рибосома. То је зато што су сами рибосоми мањи и мање сложени. Потребно је још истраживања да би се утврдило структуре рибосома виших организама, попут оних у људи. Научници се такође надају да ће научити више о рибосомалној структури патогена, како би се помогло у борби против болести.
Шта је рибозим?
Термин рибозим односи се на већу од две подјединице рибосома. Рибозим функционише као ензим, отуда је и назван. Служи као катализатор у састављању протеина.
Категоризација Рибосома према Сведберговим вредностима
Сведбергове (С) вредности описују брзину седиментације у центрифуги. Научници често описују рибосомалне јединице користећи Сведбергове вриједности. На пример, прокариоти поседују 70С рибосома који се састоје од једне јединице са 50С и једне од 30С.
Они се не сабирају јер брзина седиментације има више везе са величином и обликом него са молекуларном тежином. Еукариотске ћелије, с друге стране, садрже 80С рибосома.
Значај структуре Рибосома
Рибосоми су од суштинског значаја за цео живот, јер чине протеине који обезбеђују живот и његове градивне блокове. Неки есенцијални протеини за људски живот укључују хемоглобин у црвеним крвним ћелијама, инсулин и антитела, међу многим другима.
Једном када су истраживачи открили структуру рибосома, то је отворило нове могућности за истраживање. Једна таква могућност истраживања је за нове лекове са антибиотицима. На пример, нови лекови могу зауставити болест циљајући одређене структурне компоненте рибосома бактерија.
Захваљујући структури рибосома коју су открили Ионатх, Стеитз и Рамакрисхнан, истраживачи сада знају тачне локације између аминокиселина и места на којима протеини напуштају рибосоме. Нула на место где се антибиотици везују за рибосоме отвара много већу прецизност у деловању лекова.
Ово је пресудно у ери када су се претходно упорни антибиотици сусрели са бактеријама резистентним на антибиотике. Откривање структуре рибосома је стога од велике важности за медицину.