Структура молекула је веома важна, јер пружа информације о томе како ће молекул утицати на друга једињења. Облик диктира тачку смрзавања једињења, тачку кључања, испарљивост, стање материје, површинску напетост, вискозност и још много тога. Много је лакше разумети структуру једињења ако је видите у 3Д моделу. Различите везе имају различите углове, а различити елементи у једињењу представљени су различитим бојама. Што је више елемената и веза у једињењу то је напреднија и сложенија геометрија структуре једињења.
Нацртајте структуру изабраног молекула коришћењем тачке структуре Левиса. Левисова структура тачака приказује главне елементе, број валентних електрона и која једињења су везана за централно једињење.
Одредите углове који су потребни око сваког главног дела. Једињење које има четири везе имаће везе између 109,5 степени у тетраедарском распореду. Три везе у тригоналном равнинском распореду раздвојене су за 120 степени. Две везе изван главног једињења су линеарног распореда и раздвојене су за 180 степени.
Обојите куглицама од стиропора одговарајућим бојама. Куглице од стиропора за угљеник ће бити исте боје, кисеоник Куглице од стиропора биће друге боје, а водоничне куглице додатна боја. Што је више различитих елемената у саставу то је потребно више боја.
Спојите куглице са Попсицле штаповима или средствима за чишћење цеви. Користите углове везе једињења да исправите структуру. За једноструке везе потребан је један чистач цеви, двоструки чистач две цевне и троструке везе три чистач цеви. За чврсте везе, ставите мало лепка на крајеве средстава за чишћење цеви, пре него што их убаците у куглице од стиропора.